As algas são microorganismos vegetais que produzem substâncias orgânicas a partir de substâncias minerais e do gás carbónico da água. A sua proliferação e propagação efectua-se por esporos, que são transportados como pó por toda a atmosfera, depositando-se no interior da piscina, mesmo com cobertura.
Diferentes tipos de algas podem invadir a piscina. Existem mais de 20 000 espécies na natureza. As algas multiplicam-se rapidamente e o seu crescimento é estimulado pelas altas temperaturas, pela luz do sol, por um nível de desinfecção insuficiente, assim como, por uma água fortemente carregada de sais dissolvidos.
Com o desenvolvimento das algas, a água de uma piscina pode ser modificada fazendo com que ela fique "turva". As algas são a base de alimentação das bactérias e fungos, favorecendo a sua proliferação.